O Regimento Interno dos Conselhos Regionais de Farmácia dispõe que estes terão obrigatoriamente três Comissões Permanentes, e quantas Comissões Assessoras julgarem necessárias.

• Comissão de Tomada de Contas
  
  Função: fiscalizar, examinar e emitir parecer sobre as contas do CRF-RJ no exercício.
  Composição: 3 membros efetivos e 3 suplentes, todos Conselheiros, sem cargo na Diretoria, eleitos pelo Plenário. Cabe aos membros da Comissão escolher seu Presidente.
  Integrantes no exercício 2010/2011:
  Efetivos:
  - Tania Maria Lemos Mouço – CRF-RJ 3032
  - Celma Thomaz de Azeredo Silva - CRF-RJ 2403 - Presidente
  - Denise Costa Ribeiro - CRF-RJ 5110
  Suplentes:
  - Julio Cesar Carneiro - CRF-RJ 7277

• Comissão de Ética Profissional
  
  Função: dar andamento e emitir parecer em processos referentes à ética e à disciplina dos que exercem atividades profissionais farmacêuticas no Estado do Rio de Janeiro.
  Composição: no mínimo 3 farmacêuticos inscritos no CRF-RJ, sem cargo na Diretoria, nomeados pelo Presidente do CRF e homologados pelo Plenário. Cabe aos integrantes da Comissão escolher seu Presidente.
  Integrantes no exercício 2010/2011:
  - Fernando Savio Fonseca de Melo - CRF-RJ 5406
  - Edilberto Geraldelli - CRF-RJ 3833
  - Edmundo José Portella - CRF-RJ 3407

• Comissão de Assistência Profissional
  
  Função: avaliar e conceder auxílio a profissionais farmacêuticos necessitados, quando enfermos ou inválidos, de acordo com o parágrafo 1º do artigo 27 da Lei 3.820/60.
  Composição: 1 Conselheiro, que a preside, e 3 farmacêuticos inscritos no CRF-RJ.
  Integrantes no exercício 2010/2011:
  - Celma Thomaz de Azeredo Silva – CRF-RJ 2403
  - Julio Cesar Carneiro - CRF-RJ 7277
  - Lia Maria Loiola Galuzzio – CRF-RJ 4977
  - Marcus Vinicius Romano Athila – CRF-RJ 9622

• Comissão de Ensino
  
  Função: assessorar o CRF-RJ, estudando, emitindo pareceres e propondo ações sobre temas específicos e pertinentes ao Ensino Farmacêutico.
  Composição: constituída por farmacêuticos inscritos no CRF-RJ e com atividade docente em Curso de Graduação em Farmácia.
  Integrantes no exercício de 2011:
  - Dr. José Roberto Lannes Abib – CRF-RJ 5636 - Presidente
  - Dra. Carla Patrícia de Morais Coura – CRF-RJ 6424
  - Dra. Jamila Alessandra Perini – CRF-RJ 9021
  - Dra. Luciane Barreiro Lopez – CRF-RJ 7795
  - Dra. Melissa Manna Marques – CRF-RJ 8332
  - Dr. Valter Luiz da C. Gonçalves – CRF-RJ 12706
  - Dra. Vanessa Honorato de Oliveira – CRF-RJ 9486

• Comissão Editorial
  
  Função: definir os conteúdos e forma dos veículos de comunicação do CRF-RJ com o setor farmacêutico e a sociedade.
  Composição: constituída pela Diretoria e farmacêuticos inscritos no CRF-RJ.
  Integrantes no exercício 2010/2011:
  - Dr. Paulo Oracy da Rocha Azeredo - CRF-RJ nº 2035
  - Dr. Francisco Claudio de Souza Melo - CRF-RJ nº 6169
  - Dra. Denise Costa Ribeiro - CRF-RJ nº 5110
  - Dra. Elizabeth Zagni Schmied Gonzaga - CRF-RJ nº 5603
  - Dr. Marcos Antonio dos Santos Alves - CRF-RJ nº 5098
  - Tania Maria Lemos Mouço - CRF-RJ nº 3032

• Comissão de Licitação
  
  Função: efetuar os trabalhos relativos a processos de licitação do CRF-RJ.
  Composição: funcionários nomeados como membros e presidida por Diretor do CRF-RJ.
  - Ana Paula de Almeida Queiroz - Presidente
  - Patrícia Maria dos Santos Silva - Membro
  - Elizabeth Zagni Schmied Gonzaga - Membro
  Suplentes:
  - Fernanda de Olivaes Valle dos Santos - OAB-RJ 114266
  - Ricardo Ferreira Ribeiro - CRC-RJ 100.461/O2