O Regimento Interno dos Conselhos Regionais de Farmácia dispõe que estes terão obrigatoriamente três Comissões Permanentes, e quantas Comissões Assessoras julgarem necessárias.

• Comissão de Tomada de Contas
  
  Função: fiscalizar, examinar e emitir parecer sobre as contas do CRF-RJ no exercício.
  Composição: 3 membros efetivos e 1 suplente, todos Conselheiros, sem cargo na Diretoria, eleitos pelo Plenário. Cabe aos membros da Comissão escolher seu Presidente.
  Integrantes no exercício 2012/2013:
  Efetivos:
  - Raquel Costa Dutra Nascimento - CRF-RJ 4379 - Presidente
  - José Roberto Lannes Abib - CRF-RJ 5636
  - Julio Cesar Carneiro - CRF-RJ 7277
  Suplente:
  - Celma Thomaz de Azeredo Silva - CRF-RJ 2403

• Comissão de Ética Profissional
  
  Função: dar andamento e emitir parecer em processos referentes à ética e à disciplina dos que exercem atividades profissionais farmacêuticas no Estado do Rio de Janeiro.
  Composição: no mínimo 3 farmacêuticos inscritos no CRF-RJ, sem cargo na Diretoria, nomeados pelo Presidente do CRF e homologados pelo Plenário. Cabe aos integrantes da Comissão escolher seu Presidente.
  Integrantes no exercício 2012/2013:
  - Fernando Savio Fonseca de Melo - CRF-RJ 5406 - Presidente
  - Edilberto Geraldelli - CRF-RJ 3833
  - Edmundo José Portella - CRF-RJ 3407

• Comissão de Assistência Profissional
  
  Função: avaliar e conceder auxílio a profissionais farmacêuticos necessitados, quando enfermos ou inválidos, de acordo com o parágrafo 1º do artigo 27 da Lei 3.820/60.
  Composição: 1 Conselheiro, que a preside, e 3 farmacêuticos inscritos no CRF-RJ.
  Integrantes no exercício 2012/2013:
  - Celma Thomaz de Azeredo Silva – CRF-RJ 2403 - Presidente
  - Julio Cesar Carneiro - CRF-RJ 7277
  - Lia Maria Loiola Galuzzio – CRF-RJ 4977

• Comissão de Ensino
  
  Função: assessorar o CRF-RJ, estudando, emitindo pareceres e propondo ações sobre temas específicos e pertinentes ao Ensino Farmacêutico.
  Composição: constituída por farmacêuticos inscritos no CRF-RJ e com atividade docente em Curso de Graduação em Farmácia.
  Integrantes no exercício de 2012-2013:
  - Dr. José Roberto Lannes Abib – CRF-RJ 5636 - Presidente
  - Dr. Antonio Sergio Aymoré Martins – CRF-RJ 7565 – Vice-Presidente
  - Dra. Nilza Bachinski Pinhal – CRF-RJ 10105 – Secretária-Geral

• Comissão Editorial
  
  Função: definir os conteúdos e forma dos veículos de comunicação do CRF-RJ com o setor farmacêutico e a sociedade.
  Composição: constituída pela Diretoria e farmacêuticos inscritos no CRF-RJ.
  Integrantes no exercício 2012/2013:
  - Dr. Paulo Oracy da Rocha Azeredo - CRF-RJ nº 2035
  - Dr. Francisco Claudio de Souza Melo - CRF-RJ nº 6169
  - Dra. Denise Costa Ribeiro - CRF-RJ nº 5110
  - Dra. Tania Maria Lemos Mouço - CRF-RJ nº 3032
  - Dra. Elizabeth Zagni Schmied Gonzaga - CRF-RJ nº 5603
  - Dr. Flavio Corrêa Soares - CRF-RJ nº 9796

• Comissão de Licitação
  
  Função: efetuar os trabalhos relativos a processos de licitação do CRF-RJ.
  Composição: funcionários nomeados como membros e presidida por Diretor do CRF-RJ.
  - Tania Maria Lemos Mouço - Presidente
  - Fernanda de Olivaes Valle dos Santos - OAB-RJ 114266
  - Jurema Maria Marques de Carvalho Territo- Membro
  - Patrícia Maria dos Santos Silva - Membro
  Suplentes:
  - Elizabeth Zagni Schmied Gonzaga - Membro
  - Katia Christina Gomes da Silva Mendes - Membro