O Regimento Interno dos Conselhos Regionais de Farmácia dispõe que estes terão obrigatoriamente três Comissões Permanentes, e quantas Comissões Assessoras julgarem necessárias.

• Comissão de Tomada de Contas
  
  Função: fiscalizar, examinar e emitir parecer sobre as contas do CRF-RJ no exercício.
  Composição: 3 membros efetivos e 3 suplentes, todos Conselheiros, sem cargo na Diretoria, eleitos pelo Plenário. Cabe aos membros da Comissão escolher seu Presidente.
  Integrantes no exercício de 2008:
  Efetivos:
  - Carlos Alberto Santarem Santos - CRF-RJ 3351
  - Celma Thomaz de Azeredo Silva - CRF-RJ 2403
  - Jorge Fernando Teixeira Soares - CRF-RJ 2468
  Suplentes:
  - Ranieri Carvalho Camuzi - CRF-RJ 6707
  - Marcia de Souza Antunes - CRF-RJ 4172
  - Viviane Lima de Araujo - CRF-RJ 8267

• Comissão de Ética Profissional
  
  Função: dar andamento e emitir parecer em processos referentes à ética e à disciplina dos que exercem atividades profissionais farmacêuticas no Estado do Rio de Janeiro.
  Composição: no mínimo 3 farmacêuticos inscritos no CRF-RJ, sem cargo na Diretoria, nomeados pelo Presidente do CRF e homologados pelo Plenário. Cabe aos integrantes da Comissão escolher seu Presidente.
  Integrantes:
  - Fernando Savio Fonseca de Melo - CRF-RJ 5406
  - Edmundo José Portella - CRF-RJ 3407
  - Andreia do Amaral Nunes - CRF-RJ 5976

• Comissão de Assistência Profissional
  
  Função: avaliar e conceder auxílio a profissionais farmacêuticos necessitados, quando enfermos ou inválidos, de acordo com o parágrafo 1º do artigo 27 da Lei 3.820/60.
  Composição: 1 Conselheiro, que a preside, e 3 farmacêuticos inscritos no CRF-RJ.
  Integrantes no exercício de 2008 / 2009:
  - Celma Thomaz de Azeredo Silva – CRF-RJ 2403
  - Aline Coppola Napp – CRF-RJ 4124
  - Luiz Adonai Tavares de Moraes - CRF-RJ 1430
  - Ricardo Valdetaro de Moraes - CRF-RJ 2944

• Comissão de Ensino
  
  Função: assessorar o CRF-RJ, estudando, emitindo pareceres e propondo ações sobre temas específicos e pertinentes ao Ensino Farmacêutico.
  Composição: constituída por farmacêuticos inscritos no CRF-RJ e com atividade docente em Curso de Graduação em Farmácia.
  Integrantes no exercício de 2008 / 2009:
  - Dr. Fernando Gomes Ferreira – CRF-RJ 733 - Presidente
  - Dr. Antônio Sérgio Aymoré Martins – CRF-RJ 7565
  - Dra. Carla Patrícia de Morais Coura – CRF-RJ 6424
  - Dr. José Roberto Lannes Abib – CRF-RJ 5636
  - Dra. Luciane Barreiro Lopez – CRF-RJ 7795
  - Dra. Milene Rangel da Costa – CRF-RJ 7442
  - Dr. Saulo Roni Moraes – CRF-RJ 6598
  - Dra. Simone Sacramento Valverde Soares – CRF-RJ 6534
  - Dr. Valter Luiz da C Gonçalves – CRF-RJ 12706

• Comissão Editorial
  
  Função: definir os conteúdos e forma dos veículos de comunicação do CRF-RJ com o setor farmacêutico e a sociedade.
  Composição: constituída pela Diretoria e farmacêuticos inscritos no CRF-RJ.
  Integrantes no exercício de 2008 / 2009:
  - Dr. Paulo Oracy da Rocha Azeredo - CRF-RJ nº 2035
  - Dr. Marcus Vinicius Romano Athila - CRF-RJ nº 9622
  - Dr. Francisco Claudio de Souza Melo - CRF-RJ nº 6169
  - Dra. Ana Paula de Almeida Queiroz - CRF-RJ nº 5458
  - Dr. Rogério Ribeiro Dias - CRF-RJ nº 4516

• Comissão de Licitação
  
  Função: efetuar os trabalhos relativos a processos de licitação do CRF-RJ.
  Composição: funcionários nomeados como membros e presidida por Diretor do CRF-RJ.
  - Ana Paula de Almeida Queiroz – CRF-RJ 5458
  - Patricia Maria dos Santos Silva - OAB-RJ 110146
  - Elizabeth Zagni Schmied Gonzaga - CRF-RJ 5603
  Suplentes:
  - Fernanda de Olivaes Valle dos Santos - OAB-RJ 114266
  - Ricardo Ferreira Ribeiro - CRC-RJ 100.461/O2

• Comissão de Saúde Pública
  
  Função: assessorar o CRF-RJ, estudando, emitindo pareceres e propondo ações sobre temas específicos e pertinentes a Saúde Pública.
  Composição: constituída por farmacêuticos inscritos no CRF-RJ.
  Integrantes no exercício de 2008 / 2009:
  - Dr. Luiz Carlos Farias Mesquita - CRF-RJ nº 6001 - Coordenador
  - Dr. Elias da Silva Figueira - CRF-RJ nº 9073 - Secretário Executivo
  - Dra. Adriane Guides de Carvalho - CRF-RJ nº 6475
  - Dra. Danielle dos Santos Victoriano Guedes - CRF-RJ nº 7663
  - Dra. Heloísa dos Santos Maciel Ferreira - CRF-RJ nº 3316
  - Dra. Márcia Aparecida Macedo Calderaro - CRF-RJ nº 6186
  - Dra. Maria Aparecida Martins Correa - CRF-RJ nº 4273
  - Dra. Mary Jane Batista S. Fernandes - CRF-RJ nº 4693
  - Dra. Silvania Maria Carlos França - CRF-RJ nº 11565